[Objectif] Pour rendre l'analyse entière liée au génome de centaines d'adolescents de grandes germes de haricots nord-est, analyse complète de centaines de variantes de remplacement de QTL dans la zone de production principale de la Chine, offrent des fondations théoriques pour améliorer la généticité de la taille des particules de soja en Chine. Méthode] Obtenez 290 soja couramment utilisés dans le nord-est de la Chine, 290 soja, tels que des équipes de test, 2013 et 2014 à Kanshan Sites, Mudanjiang, Jiamusi et Xuan 4 en Asie-Asie de l'Est. Vérifiez l'identification. En utilisant la méthode RAD-SEQ pour effectuer l'analyse du génome du groupe de test, après filtrage des données SNP d'origine et remplir les données manquantes, 82966 cartes SNP de haute qualité ont finalement été obtenue. Selon l'invasion de l'entrée à plusieurs étages avec l'analyse de corrélation (analyse de Multi-Locus Broad Association RTM, RTM-GWAS), première carte SNPLDB construite avec une équivalente complexe, puis l'historique de plusieurs étages multi-étapes pour tousGénome pour une analyse d'association de poids équilibré. Analyse des gènes à proximité du solde détecté des gènes des marqueurs SNPLDB connexes (50 Ko) et des fonctions sérieuses liées sexuelles. Enfin, la différence génétique entre différents matériaux de poussée est analysée sur la base de la détection d'équivalents à des systèmes QTL 100. [Résultats] Le changement de solde de la population d'essai est de 18,3 à 20,7 g, l'héritage des caractéristiques de 92,3%. La méthode RTM-GWAS a détecté 76 marchés de marquage SNPLDB associés au poids du soja et à 15 sites Web insignifiants et 61 autres sites importants qui expliquent 65,40% des variations de phénotype; 68 sites Web montrent un site Web important d'interaction environnementale expliquée 17,46% des variations de phénotype et huit sites Web et interactions environnementales sont négligeables. Sur 76 sites Web ont été découverts, il y avait 34 sites Web qui se chevauchent avec 30 cents Poids QTLS Reporting. De plus, 42 nouveaux sites Web découverts par soupçonnésSauvegarde ça. Basé sur le balisage SNPLDB, 137 gènes candidats liés aux soldes, des commentaires fonctionnels ont montré que ces gènes candidats sont non seulement engagés dans l'ajustement du soja, mais également de la participation à la chimie originale de transfert, la modification des protéines, le transport matériel, la réponse au stress et la conversion du signal, génétique L'analyse de la distinction montre que, bien que la différence d'équilibre entre neuf ne soit pas claire, la variante génétique TRUC équivalente à QTL a changé en étudiants de première année et en retrait. [Conclusion] La méthode RTM-GWAS peut analyser le nord-est de soja associé à différents accessoires de variantes pathogènes. Bai-Nort-Northast Germpplasm Soja est réglementée par un grand nombre de QTL et d'effets d'interaction QTL et d'interaction environnementale, QTL a un remplacement complexe riche. Par la méthode RTM-GWAS Configuration de la variante de matrice équivalente à QTL fournit de nouveaux outils pour la recherche génétique et l'évolution du groupe.
2020, 53(9)
17 juin 2020
Ce document académique portant sur Germe et intitulé Toute analyse du génome du poids Baida change également QTL de grandes germes de haricots nord-est du nord-est en 1393 Chinese Agriculture a été édité et complété par Nanjing Agriculture Institute / Centre national d'amélioration du soja de soja / Ministère de l'agriculture et de l'agriculture Sana et de l'élevage génétique Laboratoire / Cultures génétiques et innovation génétique de l'État Laboratoire / Centre de changement Nouveaux cultures modernes produisant Jiangsu, Nanjing, 210095 de FuMengMeng, HaoXiaoShuai, LiuZaiDong, HeJianBo a été édité et complété. Publié à 17 juin 2020 dans le journal Science agricole chinoise, volume 2020, 53(9), National Natural Science Foundation, plan national de reproduction des plantes, échangistes de Chang Giang, prévoit de développer une équipe d'innovation, ministère de l'Éducation 111 Projets d'inspection de projets de recherche de base Université centrale, ministère de l'Agriculture Systèmes de technologie industrielle Soy-04, Province de Jiangsu Avantages de la province de Jiangsu Projets de construction de sciences, projet JCIC-MCP Jiangsu sous copyright.