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[Objectif] Basé sur la séquence de répétition SSR de la base de données EST, il a été défini la base théorique du développement de nouveaux marqueurs Kiwi Est-SSR et de la recherche biologique moléculaire. [Méthode] La dernière étiquette d'expression KIWI est publiée à partir de la base de données publique de la NCBI (la carte de séquence est affichée, l'extraction aléatoire EST 56 46 SEQUENCES ET SSRHUNER SECIBILLAIRE est utilisé pour rechercher microsatellite, SSR. Recherche standard: Dinucleotides, Tri-Nucléotide, Tetrapliattes et cinq cœurs, des répétitions minimales d'agididete et de nucléotide hexa sont 7 fois, 5 fois, 4 fois 4 fois, dont les microsatellites comprennent synthétisés. Autant de répétitions de micro, numéro de test correspondant, etc. [Résultats] 7 939 SSR a obtenu à partir de la séquence est de Kiwi, y compris la répétition du dinucléotide 5 131 (64, 63%), répétition tri-nucléotide 1 237 (15,58%), répétition de tétrapliocide 284 (3,58%), répétition p-nucléotide 397 (5,00%) et hexa Le nucléotide a été répété (11, 21%). Il y a 1 SSR dans une seule chaîne de génomeVers 2,48 Ko, la moyenne a 1 SSR dans les seulement 7 gènes.Dans la chaîne répétant le dikucléotide, AG / CT distribue 4 654 (90,70%).Dans le trikucléotide, beaucoup de primitive répétitives sont ACC / GGT, AAG / CTT et CGC / GCG, distribution totale de 817, représentant 66,04% de primitive primitive primitive répétée dans le tri-nucléotide.Dans d'autres primitives, ACG / CCT, AGC / GTA, AAC / GAT ATC / GAT, AGT / Loi, CGA / TCG, AAT / ATT 7 primitive répétée, un total de 420 chaînes SSR, représentant 33,96%.L'AGT primitif et la CGT répétez AGT et CGT ne sont pas distribués.[CONCLUSION] Dans la Séquence de l'Est Kiwiruit, répéter le dinucléotide est l'unité répétée la plus riche, suivie de la répétition de trikucléotide et de l'hexaucléotide répétée.Dans l'unité de répétition SSR, AG / CT est un avantage.

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Numéro d'édition

2009, 10(6)

Numéro de classification

S6

Classification du système

R74R59

Date de publication

20 avril 2010

Introduction

Ce document académique portant sur kiwi et intitulé Analyse des informations SSR sur la séquence Kiwi Est en 1393 Chinese Agriculture a été édité et complété par Collège agricole, Jiangxi Université agricole, Nanchang, Jiangxi 330045, Chine de XuXiaoBiao, JiangChunYa, LiaoJiao, NiZhiHua a été édité et complété. Publié à 20 avril 2010 dans le journal Science agricole et technologie (version anglaise), volume 2009, 10(6), Fondation nationale des sciences naturelles sous copyright.

Fonds et projets
Fondation nationale des sciences naturelles
Institution et adresse
Collège agricole, Jiangxi Université agricole, Nanchang, Jiangxi 330045, Chine